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Este estudio evaluó la presencia de parásitos gastrointestinales en 12 tortugas marinas de las especies Caretta caretta y Eretmochelys imbricata mantenidas ex situ en el Acuario Mundo Marino, Santa Marta. Se realizaron tres jornadas de muestreo (abril y octubre de 2022 y mayo de 2023), procesando 36 muestras fecales mediante la técnica de Ritchie. Se identificaron larvas tipo I compatibles con nematodos del género Anisakis y estructuras morfológicamente compatibles con Entamoeba spp., así como quistes posteriores a la desparasitación preventiva. Los hallazgos evidencian la presencia de formas parasitarias activas y latentes durante el proceso de rehabilitación, lo que resalta la necesidad de incorporar evaluaciones sanitarias sistemáticas y establecer protocolos clínicos previos a la liberación. La implementación de monitoreos sanitarios integrales fortalecerá los programas de conservación y reducirá el riesgo de transmisión de patógenos a poblaciones silvestres.